Artwork

محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal
Player FM - برنامه پادکست
با برنامه Player FM !

#36 scVI with Romain Lopez and Gabriel Misrachi

1:20:08
 
اشتراک گذاری
 

Manage episode 241034338 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

In this episode, we hear from Romain Lopez and Gabriel Misrachi about scVI—Single-cell Variational Inference. scVI is a probabilistic model for single-cell gene expression data that combines a hierarchical Bayesian model with deep neural networks encoding the conditional distributions. scVI scales to over one million cells and can be used for scRNA-seq normalization and batch effect removal, dimensionality reduction, visualization, and differential expression. We also discuss the recently implemented in scVI automatic hyperparameter selection via Bayesian optimization.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

Artwork
iconاشتراک گذاری
 
Manage episode 241034338 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

In this episode, we hear from Romain Lopez and Gabriel Misrachi about scVI—Single-cell Variational Inference. scVI is a probabilistic model for single-cell gene expression data that combines a hierarchical Bayesian model with deep neural networks encoding the conditional distributions. scVI scales to over one million cells and can be used for scRNA-seq normalization and batch effect removal, dimensionality reduction, visualization, and differential expression. We also discuss the recently implemented in scVI automatic hyperparameter selection via Bayesian optimization.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

Tất cả các tập

×
 
Loading …

به Player FM خوش آمدید!

Player FM در سراسر وب را برای یافتن پادکست های با کیفیت اسکن می کند تا همین الان لذت ببرید. این بهترین برنامه ی پادکست است که در اندروید، آیفون و وب کار می کند. ثبت نام کنید تا اشتراک های شما در بین دستگاه های مختلف همگام سازی شود.

 

راهنمای مرجع سریع