Artwork

محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal
Player FM - برنامه پادکست
با برنامه Player FM !

#35 The role of the DNA shape in transcription factor binding with Hassan Samee

1:01:45
 
اشتراک گذاری
 

Manage episode 238719696 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

Even though the double-stranded DNA has the famous regular helical shape, there are small variations in the geometry of the helix depending on what exact nucleotides its made of at that position.

In this episode of the bioinformatics chat, Hassan Samee talks about the role the DNA shape plays in recognition of the DNA by DNA-binding proteins, such as transcription factors. Hassan also explains how his algorithm, ShapeMF, can deduce the DNA shape motifs from the ChIP-seq data.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

Artwork
iconاشتراک گذاری
 
Manage episode 238719696 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

Even though the double-stranded DNA has the famous regular helical shape, there are small variations in the geometry of the helix depending on what exact nucleotides its made of at that position.

In this episode of the bioinformatics chat, Hassan Samee talks about the role the DNA shape plays in recognition of the DNA by DNA-binding proteins, such as transcription factors. Hassan also explains how his algorithm, ShapeMF, can deduce the DNA shape motifs from the ChIP-seq data.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

Tất cả các tập

×
 
Loading …

به Player FM خوش آمدید!

Player FM در سراسر وب را برای یافتن پادکست های با کیفیت اسکن می کند تا همین الان لذت ببرید. این بهترین برنامه ی پادکست است که در اندروید، آیفون و وب کار می کند. ثبت نام کنید تا اشتراک های شما در بین دستگاه های مختلف همگام سازی شود.

 

راهنمای مرجع سریع