Artwork

محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal
Player FM - برنامه پادکست
با برنامه Player FM !
icon Daily Deals

#54 Seeding methods for read alignment with Markus Schmidt

1:00:46
 
اشتراک گذاری
 

Manage episode 280198399 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

In this episode, Markus Schmidt explains how seeding in read alignment works. We define and compare k-mers, minimizers, MEMs, SMEMs, and maximal spanning seeds. Markus also presents his recent work on computing variable-sized seeds (MEMs, SMEMs, and maximal spanning seeds) from fixed-sized seeds (k-mers and minimizers) and his Modular Aligner.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

Artwork
iconاشتراک گذاری
 
Manage episode 280198399 series 1537951
محتوای ارائه شده توسط Roman Cheplyaka. تمام محتوای پادکست شامل قسمت‌ها، گرافیک‌ها و توضیحات پادکست مستقیماً توسط Roman Cheplyaka یا شریک پلتفرم پادکست آن‌ها آپلود و ارائه می‌شوند. اگر فکر می‌کنید شخصی بدون اجازه شما از اثر دارای حق نسخه‌برداری شما استفاده می‌کند، می‌توانید روندی که در اینجا شرح داده شده است را دنبال کنید.https://fa.player.fm/legal

In this episode, Markus Schmidt explains how seeding in read alignment works. We define and compare k-mers, minimizers, MEMs, SMEMs, and maximal spanning seeds. Markus also presents his recent work on computing variable-sized seeds (MEMs, SMEMs, and maximal spanning seeds) from fixed-sized seeds (k-mers and minimizers) and his Modular Aligner.

Links:

If you enjoyed this episode, please consider supporting the podcast on Patreon.

  continue reading

70 قسمت

All episodes

×
 
Loading …

به Player FM خوش آمدید!

Player FM در سراسر وب را برای یافتن پادکست های با کیفیت اسکن می کند تا همین الان لذت ببرید. این بهترین برنامه ی پادکست است که در اندروید، آیفون و وب کار می کند. ثبت نام کنید تا اشتراک های شما در بین دستگاه های مختلف همگام سازی شود.

 

icon Daily Deals
icon Daily Deals
icon Daily Deals

راهنمای مرجع سریع

در حین کاوش به این نمایش گوش دهید
پخش